Marcin Tabaka, dr
Magisterium na Uniwersytecie Jagiellońskim, Doktorat w Instytucie Chemii Fizycznej (PAN)
Lider Grupy CGG
Ekspresja genów, wysokoprzepustwa genomika pojedynczej komórki, reprogramowanie komórkowe, immunologia, patogeneza raka
Opis
Dr Marcin Tabaka ukończył studia magisterskie na Wydziale Chemii Uniwersytetu Jagiellońskiego w 2004 r. Stopień doktora uzyskał w 2009 roku w Instytucie Chemii Fizycznej, PAN, gdzie w latach 2010-2014 odbywał pierwszy staż podoktorski. W ramach drugiego stażu (2014-2019) pracował w kierowanym przez prof. Aviv Regev Klarman Cell Observatory w prestiżowym ośrodku Broad Institute of MIT and Harvard (Cambridge, Stany Zjednoczone).
Karierę kierownika zespołu badawczego rozpoczął w ICTER we wrześniu 2020. Dr. Marcin Tabaka jest współautorem 27 artykułów naukowych opublikowanych w wysoko notowanych czasopismach takich jak Nature, Cell, czy PNAS (Google Scholar).
Naukowe zainteresowania dr. Tabaki obejmują różnorodne obszary badawcze, w których wykorzystywana jest technologia wysokoprzepustowej genomiki na poziomie pojedynczych komórek. Badania, w jakich dotychczas był zaangażowany dotyczyły między innymi reprogramowania komórkowego, immunologii i raka.
Projekty:
OPUS 21 2021/41/B/NZ7/03786,
Science for the Society NdS-II/SP/0195/2023/01,
OPUS 25 2023/49/B/NZ9/01925,
MAB II (FENG.02.01IP.05-T005/23).
Lista publikacji
-
Ocelli: an open-source tool for the analysis and visualization of developmental multimodal single-cell data
10.1093/nargab/lqaf040
2025
-
Nature Communications
A combination treatment based on drug repurposing demonstrates mutation-agnostic efficacy in pre-clinical retinopathy models
10.1038/s41467-024-50033-5.
2024
-
The Journal of Biological Chemistry
Conditional deletion of miR-204 and miR-211 in murine retinal pigment epithelium results in retinal degeneration
10.1016/j.jbc.2024.107344
2024
-
The Journal of Biological Chemistry
Restoring retinal polyunsaturated fatty acid balance and retina function by targeting ceramide in AdipoR1-deficient mice
10.1016/j.jbc.2024.107291
2024
-
Proceedings of the National Academy of Sciences
Distinct mouse models of Stargardt disease display differences in pharmacological targeting of ceramides and inflammatory responses,
10.1073/pnas.2314698120
2023
-
bioRxiv
Ocelli: a new comprehensive method for multimodal single-cell data analysis
10.1101/2023.10.05.561074
2023
-
Nature Communications
spinDrop: a droplet microfluidic platform to maximise single-cell sequencing information content
10.1038/s41467-023-40322-w
2023
-
Proceedings of the National Academy of Sciences
Stress resilience-enhancing drugs preserve tissue structure and function in degenerating retina via phosphodiesterase inhibition
10.1073/pnas.2221045120
2023
-
JCI Insight
Inhibition of ceramide accumulation in AdipoR1–/– mice increases photoreceptor survival and improves vision
10.1172/jci.insight.156301
2022
2025 Projekty badawcze
Grupy badawcze
Badania prowadzone przez ZGO skupiają się na łączeniu podejść statystyki, fizyki statystycznej, matematyki i informatyki w rozwijaniu nowych metod obliczeniowych.
DOWIEDZ SIĘ WIĘCEJ 
