{"id":12323,"date":"2025-11-19T13:01:09","date_gmt":"2025-11-19T13:01:09","guid":{"rendered":"https:\/\/icter.pl\/?p=12323"},"modified":"2025-11-19T12:30:15","modified_gmt":"2025-11-19T12:30:15","slug":"ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/","title":{"rendered":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107"},"content":{"rendered":"\n

W \u015bwiecie nauki coraz wi\u0119cej m\u00f3wi si\u0119 o tym, \u017ce aby zrozumie\u0107 \u017cycie, trzeba obserwowa\u0107 je w rozdzielczo\u015bci pojedynczej kom\u00f3rki. Teraz, dzi\u0119ki nowemu narz\u0119dziu opracowanemu przez naukowc\u00f3w ICTER, mo\u017cliwe jest nie tylko \u015bledzenie zmian w ekspresji gen\u00f3w, ale tak\u017ce zrozumienie, jak r\u00f3\u017cne mechanizmy ich regulacji  wsp\u00f3\u0142dzia\u0142aj\u0105 w czasie. Ocelli to nowe oprogramowanie, kt\u00f3re zmienia spos\u00f3b, w jaki analizujemy i wizualizujemy wielowymiarowe dane jednokom\u00f3rkowe.<\/em><\/p>\n\n\n\n\n\n\n\n

Nowe narz\u0119dzie, nazwane Ocelli, zosta\u0142o opracowane przez doktoranta Piotra Rutkowskiego i dr. Marcina Tabak\u0119 z Mi\u0119dzynarodowego Centrum Bada\u0144 Oka (ICTER). Ocelli, kt\u00f3rego mechanizm dzia\u0142ania i zastosowanie opublikowano na \u0142amach NAR Genomics and Bioinformatics<\/em><\/a>, jest odpowiedzi\u0105 na rosn\u0105ce zapotrzebowanie na skuteczne narz\u0119dzia do analizy danych multimodalnych uzyskiwanych z pojedynczych kom\u00f3rek.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Podzia\u0142 kom\u00f3rek \/Fot. Depositphotos<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Wsp\u00f3\u0142czesne technologie sekwencjonowania pozwalaj\u0105 na r\u00f3wnoczesne pomiary transkryptomu, dost\u0119pno\u015bci chromatyny, poziom\u00f3w bia\u0142ek i modyfikacji histon\u00f3w w pojedynczych kom\u00f3rkach. Ka\u017cda z tych „modalno\u015bci” reprezentuje inny etap regulacji ekspresji gen\u00f3w – od epigenetycznych mechanizm\u00f3w kontroli po ko\u0144cowe produkty w postaci bia\u0142ek. Zrozumienie tych proces\u00f3w w ich dynamicznym przebiegu wymaga jednak narz\u0119dzi, kt\u00f3re potrafi\u0105 je analizowa\u0107 jednocze\u015bnie bez utraty rozdzielczo\u015bci biologicznej i czasowej. Ocelli w\u0142a\u015bnie to oferuje.<\/p>\n\n\n\n

Biologiczna mapa czasu<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

W odr\u00f3\u017cnieniu od dotychczasowych metod opartych g\u0142\u00f3wnie na sieciach neuronowych lub metodach probabilistycznych, Ocelli wykorzystuje unikaln\u0105 kombinacj\u0119 modelowania temat\u00f3w (topic modeling) oraz multimodalnych map dyfuzyjnych (MDM). Te ostatnie pozwalaj\u0105 traktowa\u0107 przej\u015bcia mi\u0119dzy stanami kom\u00f3rkowymi jako procesy dyfuzji w przestrzeni wielowymiarowych cech kom\u00f3rek, tworz\u0105c z\u0142o\u017con\u0105 sie\u0107 zale\u017cno\u015bci, kt\u00f3ra oddaje zar\u00f3wno globaln\u0105 struktur\u0119 r\u00f3\u017cnicowania, jak i lokalne niuanse przej\u015b\u0107 pomi\u0119dzy stanami kom\u00f3rek.<\/p>\n\n\n\n

Dzi\u0119ki temu mo\u017cliwe jest odwzorowanie trajektorii r\u00f3\u017cnicowania si\u0119 kom\u00f3rek w spos\u00f3b ci\u0105g\u0142y, z zachowaniem nieliniowo\u015bci charakterystycznej dla proces\u00f3w biologicznych. Co wi\u0119cej, Ocelli przydziela ka\u017cdej kom\u00f3rce indywidualne wagi okre\u015blaj\u0105ce, kt\u00f3ra modalno\u015b\u0107 – RNA, chromatyna, bia\u0142ka – najlepiej oddaje jej aktualny stan rozwojowy. To szczeg\u00f3lnie wa\u017cne, poniewa\u017c w r\u00f3\u017cnych etapach rozwoju znaczenie poszczeg\u00f3lnych mechanizm\u00f3w regulacji ekspresji gen\u00f3w ulega zmianie, np. w kom\u00f3rkach progenitorowych dominuj\u0105 sygna\u0142y epigenetyczne, natomiast w kom\u00f3rkach zr\u00f3\u017cnicowanych bardziej istotne s\u0105 poziomy bia\u0142ek do okre\u015blenia stan\u00f3w kom\u00f3rek.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Rekonstrukcja \u015bcie\u017cek r\u00f3\u017cnicowania w mieszku w\u0142osowym na podstawie danych SHARE-seq (dost\u0119pno\u015b\u0107 chromatyny + transkryptom): (A) Schemat trajektorii rozwoju kom\u00f3rek w regeneracyjnej cz\u0119\u015bci mieszka w\u0142osowego. (B) Wizualizacja danych SHARE-seq z u\u017cyciem Ocelli i kierunk\u00f3w r\u00f3\u017cnicowania wyznaczonych metod\u0105 scVelo. (C) Wagi dost\u0119pno\u015bci chromatyny s\u0105 wy\u017csze w kom\u00f3rkach progenitorowych (TACs), wagi transkryptomu – u kom\u00f3rek zr\u00f3\u017cnicowanych. (D) Rozk\u0142ad 10% kom\u00f3rek o najwy\u017cszych wagach w ka\u017cdej modalno\u015bci. (E) Aktywno\u015b\u0107 sygnatur genowych dla warstw: medulla i cortex (HS) oraz Huxley i Henle (IRS). (F) Analiza CellRank identyfikuje cztery ko\u0144cowe stany r\u00f3\u017cnicowania. IRS powstaj\u0105 g\u0142\u00f3wnie z TAC-1, a HS z TAC-2.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Mgr Piotr Rutkowski z ICTER, wsp\u00f3\u0142autor narz\u0119dzia Ocelli, m\u00f3wi:<\/p>\n\n\n\n

\n

W biologii rozwojowej liczy si\u0119 nie tylko to, jakie cechy kom\u00f3rki mierzymy, ale jak one zmieniaj\u0105 si\u0119 w czasie. Ocelli pozwala uchwyci\u0107 te zmiany w spos\u00f3b ci\u0105g\u0142y, nieliniowy i biologicznie sensowny, \u0142\u0105cz\u0105c r\u00f3\u017cne warstwy informacji w jedn\u0105 sp\u00f3jn\u0105 reprezentacj\u0119.<\/em><\/p>\n<\/blockquote>\n\n\n\n

Autorzy pracy przeprowadzili szereg analiz na danych symulowanych i rzeczywistych, w tym na danych SHARE-seq z mieszk\u00f3w w\u0142osowych myszy, a tak\u017ce na danych z ludzkiego szpiku kostnego (ASAP-seq, NTT-seq, SHARE-seq) i krwi (Dogma-seq). W przypadku danych syntetycznych, Ocelli z powodzeniem odtworzy\u0142o zar\u00f3wno symulowane drzewa rozwojowe z wieloma liniami kom\u00f3rkowymi, jak i bardziej z\u0142o\u017cone struktury z rzadkimi przej\u015bciami kom\u00f3rkowymi. W obydwu przypadkach narz\u0119dzie przewy\u017cszy\u0142o inne metody pod wzgl\u0119dem dok\u0142adno\u015bci rekonstrukcji \u015bcie\u017cek rozwojowych, ci\u0105g\u0142o\u015bci trajektorii i identyfikacji punkt\u00f3w rozwidle\u0144.<\/p>\n\n\n\n

W analizie danych rzeczywistych, Ocelli wykaza\u0142o wyj\u0105tkow\u0105 precyzj\u0119 w odwzorowaniu procesu r\u00f3\u017cnicowania kom\u00f3rek w regeneracyjnej cz\u0119\u015bci mieszka w\u0142osowego. Poprzez jednoczesn\u0105 analiz\u0119 danych z dost\u0119pno\u015bci chromatyny i ekspresji gen\u00f3w, narz\u0119dzie poprawnie odwzorowa\u0142o podzia\u0142 kom\u00f3rek progenitorowych (TACs) na linie r\u00f3\u017cnicuj\u0105ce si\u0119 w kierunku r\u00f3\u017cnych warstw mieszka w\u0142osowego: rdzeniowej \u0142odygi w\u0142osa (HS-Me), korowej \u0142odygi w\u0142osa (HS-Co) oraz kom\u00f3rek wewn\u0119trznej os\u0142onki korzenia (IRS): warstwy Henle’a (IRS-He) i Huxley’a (IRS-Hu). Dodatkowo, u\u017cycie narz\u0119dzia CellRank potwierdzi\u0142o, \u017ce ko\u0144cowe stany r\u00f3\u017cnicowania zidentyfikowane przez Ocelli pokrywaj\u0105 si\u0119 z najbardziej prawdopodobnymi trajektoriami bazuj\u0105cymi na algorytmach pr\u0119dko\u015bci RNA.<\/p>\n\n\n\n

Prze\u0142om w analizie danych jednokom\u00f3rkowych<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Jednym z g\u0142\u00f3wnych wyzwa\u0144 w analizie danych jednokom\u00f3rkowych jest ich olbrzymia wymiarowo\u015b\u0107 i zaszumienie. Dane z pojedynczych kom\u00f3rek s\u0105 z natury bardzo rzadkie – w przypadku RNA-seq wykrywa si\u0119 tylko 10-45% transkrypt\u00f3w, a w przypadku ATAC-seq wykrywalno\u015b\u0107 spada do 1-10% miejsc dost\u0119pnych na chromatynie. Ocelli oferuje wydajn\u0105 i matematycznie ugruntowan\u0105 metod\u0119 rekonstrukcji tych brak\u00f3w – poprzez efektywne wykorzystanie rozk\u0142adu w\u0142asnego multimodalnej macierzy Markowa, z zachowaniem informacji o strukturze danych. Pozwala to nie tylko uzupe\u0142ni\u0107 brakuj\u0105ce dane, ale r\u00f3wnie\u017c zachowa\u0107 istotne biologicznie korelacje mi\u0119dzy genami i elementami regulatorowymi.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Strategia wyboru kom\u00f3rek do szczeg\u00f3\u0142owej analizy trajektorii (ASAP-seq, szpik kostny): (A) Wizualizacja danych ASAP-seq z ludzkiego szpiku z og\u00f3ln\u0105 adnotacj\u0105 linii hematopoetycznych. (B) Wykresy pokazuj\u0105 rozk\u0142ad wag multimodalnych w ka\u017cdej grupie kom\u00f3rek z panelu (A). (C) Rozk\u0142ad 15% kom\u00f3rek z najwy\u017cszymi wagami modalno\u015bci. (D) Kom\u00f3rkom HSC przypisano warto\u015b\u0107 1 (czas t = 0), a nast\u0119pnie wykonano dyfuzj\u0119 dla t = 1, 10 i 20. (E) Kom\u00f3rki wybrane przy t = 20 poddano ponownej analizie w Ocelli. Wizualizacje FLE pokazuj\u0105 precyzyjne trajektorie hematopoezy z oznaczeniem pseudoczasu lub poziomu marker\u00f3w bia\u0142kowych.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Pod wzgl\u0119dem wydajno\u015bci obliczeniowej, Ocelli deklasuje konkurencj\u0119 – analiz\u0119 100 tysi\u0119cy kom\u00f3rek przeprowadza w mniej ni\u017c 3 minuty, co czyni je jednym z najszybszych dost\u0119pnych narz\u0119dzi tej klasy. Co wi\u0119cej, umo\u017cliwia eksploracj\u0119 podtrajektorii rozwojowych, np. r\u00f3\u017cnicowania kom\u00f3rek macierzystych szpiku w kierunku limfocyt\u00f3w B, monocyt\u00f3w czy kom\u00f3rek dendrytycznych – bez konieczno\u015bci r\u0119cznego grupowania kom\u00f3rek i selekcji klastr\u00f3w.<\/p>\n\n\n\n

Dr Marcin Tabaka, Lider Grupy CGG w ICTER, wsp\u00f3\u0142autor narz\u0119dzia Ocelli, t\u0142umaczy:<\/p>\n\n\n\n

\n

Chcieli\u015bmy stworzy\u0107 narz\u0119dzie, kt\u00f3re w spos\u00f3b dok\u0142adny b\u0119dzie odtwarza\u0107 procesy biologiczne ukryte w wielowymiarowych danych pochodz\u0105cych z profilowania multimodalnego pojedynczych kom\u00f3rek. Ocelli potrafi wyodr\u0119bni\u0107 i pokaza\u0107 z\u0142o\u017cone \u015bcie\u017cki rozwoju kom\u00f3rek – tak\u017ce te rzadkie, przej\u015bciowe czy ukryte w szumie danych. To nowy krok do przodu dla analiz danych multimodalnych.<\/em><\/p>\n<\/blockquote>\n\n\n\n

Nowe mo\u017cliwo\u015bci, nie tylko dla okulistyki<\/h2>\n\n\n\n

Ocelli otwiera nowe mo\u017cliwo\u015bci dla biologii rozwojowej, immunologii, onkologii czy medycyny regeneracyjnej. Dzi\u0119ki precyzyjnemu odwzorowaniu dynamiki stan\u00f3w kom\u00f3rkowych w czasie, narz\u0119dzie mo\u017ce by\u0107 stosowane do analizy proces\u00f3w takich jak r\u00f3\u017cnicowanie kom\u00f3rek macierzystych, progresja nowotwor\u00f3w, odpowiedzi immunologiczne czy dzia\u0142anie terapii eksperymentalnych. W odr\u00f3\u017cnieniu od sieci neuronowych, Ocelli pozwala spojrze\u0107 i zrozumie\u0107 dane jako proces – dynamiczny, ci\u0105g\u0142y, kierunkowy.<\/p>\n\n\n\n

Jak podkre\u015blaj\u0105 autorzy, jedn\u0105 z g\u0142\u00f3wnych zalet narz\u0119dzia jest jego pe\u0142na transparentno\u015b\u0107, elastyczno\u015b\u0107 i dost\u0119pno\u015b\u0107 – kod \u017ar\u00f3d\u0142owy Ocelli jest publicznie dost\u0119pny wraz z dokumentacj\u0105 i przyk\u0142adami zastosowa\u0144. Pozwala to ka\u017cdemu zespo\u0142owi badawczemu na dostosowanie algorytmu do w\u0142asnych potrzeb, niezale\u017cnie od rodzaju analizowanej tkanki.<\/p>\n\n\n\n

\n\n\n\n

\u0179r\u00f3d\u0142o: Piotr Rutkowski, Marcin Tabaka (2025). Ocelli: an open-source tool for the analysis and visualization of developmental multimodal single-cell data<\/strong>. NAR Genomics and Bioinformatics<\/em>. <\/p>\n\n\n\n

DOI: https:\/\/doi.org\/10.1093\/nargab\/lqaf040<\/a><\/p>\n\n\n\n

Autor: Redaktor Naukowy Marcin Pow\u0119ska<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

W \u015bwiecie nauki coraz wi\u0119cej m\u00f3wi si\u0119 o tym, \u017ce aby zrozumie\u0107 \u017cycie, trzeba obserwowa\u0107 je w rozdzielczo\u015bci pojedynczej kom\u00f3rki. Teraz, dzi\u0119ki nowemu narz\u0119dziu opracowanemu przez naukowc\u00f3w ICTER, mo\u017cliwe jest nie tylko \u015bledzenie zmian w ekspresji gen\u00f3w, ale tak\u017ce zrozumienie, jak r\u00f3\u017cne mechanizmy ich regulacji  wsp\u00f3\u0142dzia\u0142aj\u0105 w czasie. Ocelli to nowe oprogramowanie, kt\u00f3re zmienia spos\u00f3b, w […]<\/p>\n","protected":false},"author":35,"featured_media":12331,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[66,69,163],"tags":[],"coauthors":[545],"class_list":["post-12323","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-aktualnosci","category-badania","category-zespol-genomiki-obliczeniowej"],"acf":[],"yoast_head":"\nOcelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"noindex, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"pl_PL\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"W \u015bwiecie nauki coraz wi\u0119cej m\u00f3wi si\u0119 o tym, \u017ce aby zrozumie\u0107 \u017cycie, trzeba obserwowa\u0107 je w rozdzielczo\u015bci pojedynczej kom\u00f3rki. Teraz, dzi\u0119ki nowemu narz\u0119dziu opracowanemu przez naukowc\u00f3w ICTER, mo\u017cliwe jest nie tylko \u015bledzenie zmian w ekspresji gen\u00f3w, ale tak\u017ce zrozumienie, jak r\u00f3\u017cne mechanizmy ich regulacji  wsp\u00f3\u0142dzia\u0142aj\u0105 w czasie. Ocelli to nowe oprogramowanie, kt\u00f3re zmienia spos\u00f3b, w […]\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"ICTER\" \/>\n<meta property=\"article:publisher\" content=\"https:\/\/www.facebook.com\/icterresearch\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2025-11-19T13:01:09+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/icter.local\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"2560\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"1440\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/jpeg\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Marcin Pow\u0119ska\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:creator\" content=\"@icter_pl\" \/>\n<meta name=\"twitter:site\" content=\"@icter_pl\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Napisane przez\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Marcin Pow\u0119ska\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Szacowany czas czytania\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"7 minut\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label3\" content=\"Written by\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data3\" content=\"Marcin Pow\u0119ska\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\\\/\\\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"Article\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#article\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/\"},\"author\":{\"name\":\"Marcin Pow\u0119ska\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/2ddaa3787d96d0ee5d74f5022a5a0aa2\"},\"headline\":\"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107\",\"datePublished\":\"2025-11-19T13:01:09+00:00\",\"mainEntityOfPage\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/\"},\"wordCount\":1353,\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#organization\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2025\\\/11\\\/komorki-podzial-scaled.jpg\",\"articleSection\":[\"Aktualno\u015bci\",\"Badania\",\"Zesp\u00f3\u0142 Genomiki Obliczeniowej\"],\"inLanguage\":\"pl-PL\"},{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/\",\"name\":\"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#website\"},\"primaryImageOfPage\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#primaryimage\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#primaryimage\"},\"thumbnailUrl\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2025\\\/11\\\/komorki-podzial-scaled.jpg\",\"datePublished\":\"2025-11-19T13:01:09+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/\"]}]},{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#primaryimage\",\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2025\\\/11\\\/komorki-podzial-scaled.jpg\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2025\\\/11\\\/komorki-podzial-scaled.jpg\",\"width\":2560,\"height\":1440,\"caption\":\"Podzia\u0142 kom\u00f3rek \\\/Fot. Depositphotos\"},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\\\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#website\",\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/\",\"name\":\"International Centre for Translational Eye Research\",\"description\":\"The International Center for Translational Eye Research\",\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#organization\"},\"alternateName\":\"ICTER\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"pl-PL\"},{\"@type\":\"Organization\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#organization\",\"name\":\"International Centre for Translational Eye Research\",\"alternateName\":\"ICTER\",\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/\",\"logo\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2021\\\/10\\\/logo-blue.png\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2021\\\/10\\\/logo-blue.png\",\"width\":806,\"height\":122,\"caption\":\"International Centre for Translational Eye Research\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\"},\"sameAs\":[\"https:\\\/\\\/www.facebook.com\\\/icterresearch\",\"https:\\\/\\\/x.com\\\/icter_pl\",\"https:\\\/\\\/www.linkedin.com\\\/company\\\/international-centre-for-translational-eye-research\\\/\"]},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/2ddaa3787d96d0ee5d74f5022a5a0aa2\",\"name\":\"Marcin Pow\u0119ska\",\"image\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/secure.gravatar.com\\\/avatar\\\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g73f3c72dbe5a84495254c2614f002810\",\"url\":\"https:\\\/\\\/secure.gravatar.com\\\/avatar\\\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/secure.gravatar.com\\\/avatar\\\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g\",\"caption\":\"Marcin Pow\u0119ska\"},\"url\":\"https:\\\/\\\/icter.jcd.pl\\\/pl\\\/author\\\/marcin-poweska\\\/\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER","robots":{"index":"noindex","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"og_locale":"pl_PL","og_type":"article","og_title":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER","og_description":"W \u015bwiecie nauki coraz wi\u0119cej m\u00f3wi si\u0119 o tym, \u017ce aby zrozumie\u0107 \u017cycie, trzeba obserwowa\u0107 je w rozdzielczo\u015bci pojedynczej kom\u00f3rki. Teraz, dzi\u0119ki nowemu narz\u0119dziu opracowanemu przez naukowc\u00f3w ICTER, mo\u017cliwe jest nie tylko \u015bledzenie zmian w ekspresji gen\u00f3w, ale tak\u017ce zrozumienie, jak r\u00f3\u017cne mechanizmy ich regulacji  wsp\u00f3\u0142dzia\u0142aj\u0105 w czasie. Ocelli to nowe oprogramowanie, kt\u00f3re zmienia spos\u00f3b, w […]","og_url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/","og_site_name":"ICTER","article_publisher":"https:\/\/www.facebook.com\/icterresearch","article_published_time":"2025-11-19T13:01:09+00:00","og_image":[{"width":2560,"height":1440,"url":"https:\/\/icter.local\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg","type":"image\/jpeg"}],"author":"Marcin Pow\u0119ska","twitter_card":"summary_large_image","twitter_creator":"@icter_pl","twitter_site":"@icter_pl","twitter_misc":{"Napisane przez":"Marcin Pow\u0119ska","Szacowany czas czytania":"7 minut","Written by":"Marcin Pow\u0119ska"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"Article","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#article","isPartOf":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/"},"author":{"name":"Marcin Pow\u0119ska","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#\/schema\/person\/2ddaa3787d96d0ee5d74f5022a5a0aa2"},"headline":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107","datePublished":"2025-11-19T13:01:09+00:00","mainEntityOfPage":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/"},"wordCount":1353,"publisher":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#organization"},"image":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg","articleSection":["Aktualno\u015bci","Badania","Zesp\u00f3\u0142 Genomiki Obliczeniowej"],"inLanguage":"pl-PL"},{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/","url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/","name":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107 - ICTER","isPartOf":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#website"},"primaryImageOfPage":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#primaryimage"},"image":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#primaryimage"},"thumbnailUrl":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg","datePublished":"2025-11-19T13:01:09+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#breadcrumb"},"inLanguage":"pl-PL","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/"]}]},{"@type":"ImageObject","inLanguage":"pl-PL","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#primaryimage","url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg","contentUrl":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2025\/11\/komorki-podzial-scaled.jpg","width":2560,"height":1440,"caption":"Podzia\u0142 kom\u00f3rek \/Fot. Depositphotos"},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/ocelli-matematyczny-model-podzial-komorek\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Ocelli: matematyczne oko, kt\u00f3re zagl\u0105da do wn\u0119trza kom\u00f3rek i odkrywa ich przysz\u0142o\u015b\u0107"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#website","url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/","name":"International Centre for Translational Eye Research","description":"The International Center for Translational Eye Research","publisher":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#organization"},"alternateName":"ICTER","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"pl-PL"},{"@type":"Organization","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#organization","name":"International Centre for Translational Eye Research","alternateName":"ICTER","url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/","logo":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"pl-PL","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#\/schema\/logo\/image\/","url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/logo-blue.png","contentUrl":"https:\/\/icter.jcd.pl\/wp-content\/uploads\/2021\/10\/logo-blue.png","width":806,"height":122,"caption":"International Centre for Translational Eye Research"},"image":{"@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#\/schema\/logo\/image\/"},"sameAs":["https:\/\/www.facebook.com\/icterresearch","https:\/\/x.com\/icter_pl","https:\/\/www.linkedin.com\/company\/international-centre-for-translational-eye-research\/"]},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/#\/schema\/person\/2ddaa3787d96d0ee5d74f5022a5a0aa2","name":"Marcin Pow\u0119ska","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"pl-PL","@id":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g73f3c72dbe5a84495254c2614f002810","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/3f8c6bb69a541c90c0d2bde7668968e90d89dfc1033fb4ff29ec6b2b8bdb0cb3?s=96&d=mm&r=g","caption":"Marcin Pow\u0119ska"},"url":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/author\/marcin-poweska\/"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12323","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/35"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=12323"}],"version-history":[{"count":6,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12323\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":12346,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12323\/revisions\/12346"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/media\/12331"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=12323"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=12323"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=12323"},{"taxonomy":"author","embeddable":true,"href":"https:\/\/icter.jcd.pl\/pl\/wp-json\/wp\/v2\/coauthors?post=12323"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}